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白喉棒杆菌探针法荧光定量PCR试剂盒
白喉棒杆菌探针法荧光定量PCR试剂盒图片
包装: 50次
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产品别名:Corynebacterium diphtheriae Probe qPCR Kit
产品介绍

产品及特点

白喉杆菌(Corynebacterium diphtheriae)是引起小儿白喉的病原菌,属于棒状杆菌属(Corynebacterium)。菌体大小为(0.3~0.8μm)×(1~5μm),细长稍弯,粗细不一,菌体一端或两端排列呈棒状,排列不规则,常呈L、V、X、T等字形或排成栅栏状。本菌的致病物质主要是白喉毒素,可尚产生一些侵袭性物质,如类似于结核杆菌的索状因子(Cord factor),能破坏细胞的线粒体膜,导致呼吸和氧化磷酸化作用受到抑制。

因此快速灵敏检测白喉棒杆菌具有重要意义。本产品就是以探针法荧光定量PCR技术为基础开发的专门检测白喉棒杆菌通用型的试剂盒,它具有下列特点:

1、即开即用,用户只需要提供样品DNA模板。

2、引物和探针经过优化,灵敏性高。

3、提供阳性对照,便于区分假阴性样品。

4、特异性高,引物是根据白喉棒杆菌通用DNA高度保守区设计,不会跟其他微生物的DNA发生交叉反应。

5、既可用于定性检测,又可用于定量检测。用于定量检测时线性范围至少为5个数量级。

6、本产品足够50次20μL体系的探针法荧光定量PCR反应。

7、本产品只能用于科研。

格及成分

成分

编号

五孔盒包装

2×Probe qPCR MagicMix

190303

500 μL(红盖)

荧光PCR专用模板稀释液

180701

1 mL(绿盖)

超纯水

100935

1 mL(白盖)

白喉棒杆菌探针法qPCR引物-探针混合液

15-15820yp

150μL(棕色管)

白喉棒杆菌探针法qPCR阳性对照(1×107拷贝/μL)

15820pc

50 μL(黄盖)

使用手册

15-15820sc

1份

运输及保存

低温运输,-20℃保存,保存期限为12个月。

自备试剂

样品DNA。

使用方法

一、稀释标准曲线样品(以10E1-106拷贝/μL这6个10倍稀释度为例)。由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原,本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供无传染性的DNA片段作为阳性对照。

1、标记6个离心管,分别为6,5,4,3,2,1。

2、用带芯枪头分别加入45 μL荧光PCR专用模板稀释液,**用带芯枪头,下同。

3、在6号管中加入5 μL 1×107拷贝/μL的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡1分钟,得1×106拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。

4、换枪头,在5号管中加入5 μL 1×106拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1×105拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。

5、换枪头,在4号管中加入5 μL 1×105拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1×104拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。

6、重复上面的操作直到得到6个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。

二、样品DNA的制备

7、如果有N个样品待提取,**设置N+2个提取,多出的是PC(样品制备阳性对照)和NC(样品制备阴性对照)。可以取阳性对照的1000倍稀释液10μL再加上一定量的水,使总体积与待提取样品的规定体积一致,以此作为PC。另外用水作为NC。

8、用自选方法纯化样品的DNA,本试剂盒跟市场上大多数DNA提取试剂盒兼容。

三、ProbeqPCR反应(20μL体系,在样品制备室进行)

9、如果做定量分析并且只做1次重复,则标记N+9个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照(用水做模板),6个用于标准曲线。如果做定性分析,并且只做1次重复,则标记N+4个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照(用水做模板),1个用于PCR阳性对照(用第4号管的阳性对照稀释液做模板)。下面只以定量分析为例描述操作步骤。

10、在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后最后加):

成分/每管

样品管

N+2

PCR阴性对照管

标准曲线

样品管(1-6管)

2×ProbeqPCR   MagicMix

10 μL

10 μL

10 μL

白喉棒杆菌探针法qPCR引物-探针混合液

3 μL

3 μL

3 μL

N+2个待测DNA模板

7 μL

-

-

超纯水

-

7 μL

-

第6步所得标准曲线样品稀释液(1-6号)

-

-

7 μL(1号样到1号管,2号样到2号管…)

11、盖上盖子后上机,按下面参数进行PCR:

过程

温度

时间

预变性

95℃

10 min

PCR反应(45个循环)

95℃

15sec

58℃

30 sec

72℃

60sec(采集FAM通道的荧光信号)

四、数据处理

12、如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的log值为横轴,以Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的Ct值从标准曲线上推算出样品RNA浓度的log值,再推算出其浓度。

13、如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照Ct必须大于或等于40。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct值应该小于或等于38。对待测样品,如果其Ct大于或等于40则为阴性,如果小于或等于38则为阳性。如果在38-40之间,则重复一次。重复实验的Ct值如果大于或等于40则为阴性,如果小于40,则为阳性。

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